Hola,
A mí también me ha pasado más de una vez que en los teléfonos de asistencia de Hacienda me han dado instrucciones diferentes ante un mismo problema.
Te recomiendo que esperes a la respuesta de alguien que domine el tema, pero como yo, en el pasado, me encontré en tu situación, te digo lo que yo hice.
En las facturas a las CCPP, les cobraba IVA y hacía la retención de IRPF (en aquel entonces un 7% porque estaba empezando). Esto implicaba que las CCPP debían a su vez y en su momento, declarar e ingresar en Hacienda el porcentaje que IRPF que me retenían. No recuerdo ahora qué modelos eran.
No sé si es correcto o no, pero es lo que yo hice y nunca hubo ningún problema. Si no era lo correcto...la culpa es de los asesores telefónicos de Hacienda

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En cuanto al IVA de las cuotas de abogado y de la mutualidad... que yo sepa ni una cosa ni la otra están sujetas y no exentas, es decir, creo que no llevan IVA.
Insisto en todo caso que esperes la respuesta de los entendidos.
Saludos.