De entrada te diria que la retención del 35% parece muy alta si no has trabado el año entero. Lo que supongo ha hecho la empresa es tener en cuenta tus retribuciones totales estimadas de este añó (es decir, lo que cobrastes anteriormente y lo que cobrarás hasta final de año) y recalcular la retención. Te aconsejo que lo hables con la empresa y/o te bajes de la página de la AEAT el programa de ayuda de cáculo de retenciones, entres tus datos, y compruebes que retención ANUAL de da. A partir de aqui, calcula la que te tienen que aplicar en lo que queda de año para que al final sea la correcta.