Estimados amigos, tengo una duda, derivada quizás de la inexperiencia con este tipo de sociedad.

Se trata de una sociedad limitada dedicada a la enseñanza
Esta sociedad sólo ejerce actividades exentas de IVA, de manera que no puede realizar autoliquidaciones de IVA. Pues bien, dado que no puede realizar estas autoliquidaciones según el Impuesto de sociedades el importe correspondiente a la cuota de IVA es mayor Gasto. Hasta aquí todo perfecto, pero he aquí mis dudas.
1ª Al confeccionar el libro de facturas recibidas, he de separar la Base Imponible de la Cuota de IVA.
2º Al confeccionar El impuesto de Sociedades todo es Base Imponible (tanto la base de esa factura como la cuota de IVA).
En ambos casos, en mi opinión tiene fácil solución a la hora de hacer el asiento contable, esto es tomar la cuenta de gasto que corresponda en lugar de la 472.
Y así quedaría bien confeccionado tanto uno como el otro.

Ejemplo:
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  100,00         6000001   Compra de MMPP X         
  16,00           6000001   IVA S/ Compra de MMPP X
                                                                               a                   (4000001 proveedor A) 116,00
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Ahora bien, esto con mi programa contable A3ECO, está resuelto en el caso de personas físicas, pues en el apartado de actividades si de IVA se está exento, se puede accionar una casilla que indica repercutir IVA en IRPF,. Pero si se trata de Una sociedad limitada, impuesto de Sociedades, Esta casilla no existe.
Entonces, ¿Hay algún Tema Contable o Fiscal que no conozco?, ¿es un error del programa?, no lo sé. ¿Podrías echarme una mano con este asunto?
Saludos